MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 8943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTAA	2	8	66	73	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TTAA	2	8	132	139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	TTAT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013407	ATTAA	2	10	200	209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013407	ATC	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013407	T	6	6	395	400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013407	TTTAAG	2	12	447	458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013407	TTA	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013407	CTG	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013407	TAA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013407	AT	3	6	638	643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013407	ATT	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013407	T	6	6	670	675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013407	AATA	2	8	689	696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013407	TA	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013407	TAC	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013407	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013407	TAAAA	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013407	TAAA	2	8	2024	2031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013407	ATA	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013407	TATAT	2	10	2116	2125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013407	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013407	A	9	9	4798	4806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013407	TCA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013407	CCA	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013407	T	6	6	9095	9100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013407	AT	3	6	9134	9139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013407	T	6	6	9156	9161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013407	TAA	2	6	9185	9190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013407	T	6	6	10637	10642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013407	T	7	7	10645	10651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013407	ATTT	2	8	10654	10661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013407	T	6	6	10659	10664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013407	T	7	7	10723	10729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013407	AT	3	6	10743	10748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013407	AT	4	8	10814	10821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013407	T	6	6	10831	10836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013407	TTTC	2	8	10909	10916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013407	ATT	2	6	10918	10923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013407	ATTA	2	8	12394	12401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013407	TAT	2	6	14218	14223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013407	A	6	6	14239	14244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013407	TAA	2	6	14283	14288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013407	A	6	6	14287	14292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013407	TAAA	3	12	14293	14304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013407	ATTA	2	8	15353	15360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013407	TAAT	3	12	15364	15375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013407	T	6	6	15401	15406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013407	TAA	3	9	15442	15450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013407	CAAAA	2	10	15476	15485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013407	T	6	6	16408	16413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013407	CT	3	6	16419	16424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013407	ATT	2	6	16470	16475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013407	ACA	2	6	16476	16481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013407	ATT	2	6	16504	16509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013407	TA	4	8	16534	16541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013407	CAAAAT	2	12	16573	16584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013407	TAAC	2	8	18061	18068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013407	TTA	2	6	19322	19327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013407	AAAAT	2	10	20420	20429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013407	TCCC	2	8	21974	21981	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_013407	TCT	2	6	22016	22021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013407	TTC	2	6	22028	22033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013407	CTT	2	6	23422	23427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013407	TAA	2	6	23442	23447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013407	AAC	2	6	23455	23460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013407	T	6	6	23480	23485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013407	ATC	2	6	23524	23529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013407	CTTAT	2	10	23540	23549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013407	TAA	2	6	23572	23577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013407	CT	3	6	23579	23584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013407	GACA	2	8	23662	23669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013407	T	6	6	23677	23682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013407	ATT	2	6	23683	23688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013407	CCCT	2	8	23769	23776	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_013407	CCT	2	6	23825	23830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013407	CGAAG	2	10	23868	23877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013407	CCCA	2	8	23912	23919	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_013407	TAA	2	6	23920	23925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013407	AAT	2	6	23940	23945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013407	TAT	2	6	23946	23951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013407	AT	3	6	23962	23967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013407	CGCC	2	8	23978	23985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013407	GAG	2	6	24007	24012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013407	TCA	2	6	24044	24049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013407	TTC	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013407	TAA	2	6	25355	25360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013407	T	6	6	25399	25404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013407	A	6	6	25407	25412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013407	A	6	6	25454	25459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013407	A	6	6	25476	25481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013407	A	6	6	25489	25494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013407	AAAT	2	8	25499	25506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013407	ATT	2	6	26645	26650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013407	AT	3	6	26664	26669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013407	A	6	6	26707	26712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013407	TAT	2	6	26714	26719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013407	A	6	6	26751	26756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	AAGATT	2	12	26759	26770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013407	TAA	2	6	26828	26833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013407	A	7	7	26832	26838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013407	TAAA	2	8	26840	26847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013407	A	6	6	26845	26850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013407	ATT	2	6	26866	26871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	TCT	2	6	26894	26899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013407	T	6	6	27506	27511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013407	AT	3	6	27512	27517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013407	GTA	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013407	TTAT	2	8	27557	27564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013407	AT	4	8	27569	27576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013407	ATTA	2	8	27587	27594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	AT	4	8	27615	27622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013407	TA	4	8	27638	27645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013407	AT	3	6	27672	27677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	ATT	2	6	27977	27982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013407	AAC	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013407	AAC	2	6	27999	28004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013407	AAC	2	6	28007	28012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013407	TAAT	2	8	28025	28032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	T	6	6	30117	30122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	TAA	2	6	30138	30143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013407	ATA	2	6	30178	30183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013407	CAT	2	6	30209	30214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013407	ATAA	2	8	30276	30283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013407	ATTA	2	8	30297	30304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013407	AAT	2	6	30305	30310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013407	A	6	6	30317	30322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013407	ATAAAA	2	12	30330	30341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013407	A	6	6	30338	30343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013407	GGT	2	6	30374	30379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013407	AAAC	2	8	32534	32541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013407	TAAAAA	2	12	34550	34561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013407	A	6	6	34571	34576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013407	ATT	2	6	34595	34600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013407	TTTTAT	2	12	34616	34627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013407	A	6	6	35176	35181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013407	AGAC	2	8	36814	36821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013407	A	7	7	36853	36859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013407	TTC	2	6	36871	36876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013407	ATA	2	6	39051	39056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013407	TAT	2	6	39065	39070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013407	TAT	2	6	39082	39087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013407	GTTT	2	8	39110	39117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013407	T	6	6	39115	39120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013407	AT	3	6	39125	39130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013407	TAAA	2	8	39173	39180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013407	TAA	2	6	39185	39190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013407	A	7	7	39189	39195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013407	A	7	7	39202	39208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013407	ATT	2	6	39221	39226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013407	AAG	2	6	39266	39271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013407	AAAC	2	8	39288	39295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013407	TAA	2	6	39298	39303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013407	AAATTA	2	12	39304	39315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013407	TA	5	10	39314	39323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013407	TTAATT	2	12	39343	39354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013407	A	6	6	39389	39394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013407	A	6	6	39409	39414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013407	A	6	6	39420	39425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013407	TA	3	6	39444	39449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013407	AC	3	6	39460	39465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013407	AT	4	8	39475	39482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013407	A	6	6	39485	39490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013407	A	6	6	39512	39517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013407	ATA	2	6	39520	39525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013407	AAT	2	6	39554	39559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013407	AT	3	6	39624	39629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013407	ATAAC	2	10	39639	39648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_013407	ATCT	2	8	40336	40343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_013407	T	7	7	40343	40349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013407	CAA	2	6	40398	40403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_013407	ATA	2	6	40413	40418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_013407	TATAT	2	10	40452	40461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_013407	TA	3	6	40504	40509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013407	A	7	7	40513	40519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013407	TAA	2	6	40523	40528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013407	T	7	7	40561	40567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013407	CTT	2	6	40579	40584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_013407	AGA	2	6	40770	40775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_013407	T	6	6	42550	42555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_013407	TTTA	2	8	42557	42564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_013407	TTAT	2	8	44292	44299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_013407	T	6	6	53162	53167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_013407	ATT	2	6	53291	53296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_013407	TTA	2	6	112778	112783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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